Paquet : provean (1.1.5+ds-2)

[ Paquet source : provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Autres paquets associés à provean

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, mipsel]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger provean

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	48,1 ko	141,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	44,7 ko	125,0 ko	[liste des fichiers]
armel	45,4 ko	132,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	47,1 ko	108,0 ko	[liste des fichiers]
i386	51,0 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	49,9 ko	166,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	50,1 ko	160,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	48,8 ko	153,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	44,1 ko	137,0 ko	[liste des fichiers]