Paketti: provean (1.1.5+ds-2)

[ Source: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Muut pakettiin provean liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, mipsel]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi provean

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	48.1 kt	141.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	44.7 kt	125.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	45.4 kt	132.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	47.1 kt	108.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	51.0 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	49.9 kt	166.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	50.1 kt	160.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	48.8 kt	153.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	44.1 kt	137.0 kt	[tiedostoluettelo]