Pakket: spoa (4.1.4-1)

[ Bron: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere aan spoa gerelateerde pakketten

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
  Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [niet armel, armhf]

  GCC support bibliotheek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [niet armel, armhf]

  compressiebibliotheek - programma's

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

spoa downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms

Platform	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	37,2 kB	82,0 kB	[overzicht]
arm64	36,0 kB	98,0 kB	[overzicht]
armel	34,7 kB	73,0 kB	[overzicht]
armhf	34,0 kB	61,0 kB	[overzicht]
i386	37,8 kB	77,0 kB	[overzicht]
mips64el	36,3 kB	100,0 kB	[overzicht]
ppc64el	37,7 kB	98,0 kB	[overzicht]
s390x	37,1 kB	78,0 kB	[overzicht]