Paket: spoa (4.1.4-2 und andere)

[ Quellcode: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	4.1.4-2+b1	37,4 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	4.1.4-2+b1	36,1 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	4.1.4-2+b1	34,7 kB	74,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	4.1.4-2+b1	34,2 kB	62,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	4.1.4-2+b1	37,8 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	4.1.4-2+b1	36,2 kB	101,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	4.1.4-2+b1	37,5 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	4.1.4-2+b1	35,9 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	4.1.4-2+b1	37,2 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]