Package: bowtie (1.3.1-3) [debports]
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- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Similar packages:
초고속 메모리 효율적인 짧은 읽기 정렬기
이 패키지는 최신 (2010) DNA 염기서열 분석 기술의 결과를 해석하기 위해 문제를 해결합니다. 이는 상당히 짧은 범위를 생성하며 작접적으로 해석할 수 없습니다. Bowtie와 같은 도구는 실행당 시퀀싱된 DNA의 짧은 길이에 염색체 위치를 제공하는 것은 어려운 일입니다.
Bowtie는 짧은 DNA 서열 (읽기)을 시간당 2,500만 개 이상의 35bp 시간당 읽기 속도로 인간 게놈에 정렬합니다. Bowtie는 메모리 공간을 작게 유지하기 위해 Burrows-Wheeler 인덱스로 게놈을 인덱스화합니다: 일반적으로 인간 게놈의 경우 2.2GB (페어드 엔드의 경우 2.9GB) 입니다.
Other Packages Related to bowtie
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 기능 지원 라이브러리
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 표준 C++ 라이브러리 v3
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 압축 라이브러리 - 런타임
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- sug: bowtie-examples
- Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner
Download bowtie
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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sparc64 (unofficial port) | 1,149.4 kB | 14,721.0 kB | [list of files] |