パッケージ: cassiopee (1.0.9-4 など)

[ ソース: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

その他の cassiopee 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgoogle-glog0v6t64 (>= 0.6.0)

  library that implements application-level logging.

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

cassiopee のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.0.9-4+b1	17.2 kB	71.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.0.9-4+b1	16.3 kB	155.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.0.9-4+b1	15.8 kB	57.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.0.9-4+b1	15.6 kB	53.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.0.9-4+b1	17.7 kB	65.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.0.9-4+b1	17.1 kB	157.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.0.9-4+b1	17.5 kB	155.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.0.9-4+b1	16.5 kB	63.0 kB	[ファイル一覧]