[ ソース: cassiopee ]
パッケージ: cassiopee (1.0.9-3 など)
index and search tool in genomic sequences
Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.
This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.
その他の cassiopee 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]
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- dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)
- library implementating search algorithms
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgoogle-glog0v6 (>= 0.6.0~rc1)
- library that implements application-level logging.
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
cassiopee のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 1.0.9-3+b2 | 17.8 kB | 76.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 1.0.9-3+b2 | 17.1 kB | 64.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 1.0.9-3+b2 | 16.3 kB | 54.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 1.0.9-3+b2 | 16.3 kB | 54.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 1.0.9-3+b2 | 18.3 kB | 66.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 1.0.9-3+b2 | 17.7 kB | 70.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 1.0.9-3+b2 | 17.4 kB | 60.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 1.0.9-3+b2 | 18.2 kB | 156.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 1.0.9-3+b2 | 16.9 kB | 68.0 kB | [ファイル一覧] |