パッケージ: blasr (5.3-1 など) [debports]
mapping single-molecule sequencing reads
Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.
その他の blasr 関連パッケージ
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- dep: libblasr
- tools for aligning PacBio reads to target sequences
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- dep: libc6 (>= 2.16)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- パッケージは利用できません
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- dep: libhdf5-100
- パッケージは利用できません
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- dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0)
- パッケージは利用できません
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- dep: libpbdata
- tools for handling PacBio sequences
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- dep: libpbihdf
- tools for handling PacBio hdf5 files
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム