Paketti: blasr (5.3-1 ja muut) [debports]

[ Source:  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Muut pakettiin blasr liittyvät paketit

• dep: libblasr

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.16)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Paketti ei saatavilla

• dep: libhdf5-100

  Paketti ei saatavilla

• dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0)

  Paketti ei saatavilla

• dep: libpbdata

  tools for handling PacBio sequences

• dep: libpbihdf

  tools for handling PacBio hdf5 files

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi blasr

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
x32 (epävirallinen siirros)	5.3-1+b1	459.5 kt	1,607.0 kt	[tiedostoluettelo]