Paket: blasr (5.3-1 und andere) [debports]

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mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Andere Pakete mit Bezug zu blasr

• dep: libblasr

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.16)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Paket nicht verfügbar

• dep: libhdf5-100

  Paket nicht verfügbar

• dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0)

  Paket nicht verfügbar

• dep: libpbdata

  tools for handling PacBio sequences

• dep: libpbihdf

  tools for handling PacBio hdf5 files

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
x32 (inoffizielle Portierung)	5.3-1+b1	459,5 kB	1.607,0 kB	[Liste der Dateien]