パッケージ: primer3 (2.6.1-5 など)

[ ソース: primer3  ]

tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification

Primer3 picks primers for Polymerase Chain Reactions (PCRs), considering as criteria oligonucleotide melting temperature, size, GC content and primer-dimer possibilities, PCR product size, positional constraints within the source sequence, and miscellaneous other constraints. All of these criteria are user-specifiable as constraints, and some are specifiable as terms in an objective function that characterizes an optimal primer pair.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の primer3 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• sug: ncbi-epcr

  Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites

• enh: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

primer3 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.6.1-5	194.9 kB	986.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.6.1-5	199.2 kB	806.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.6.1-5	182.3 kB	922.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.6.1-5	188.0 kB	790.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.6.1-5	180.0 kB	666.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.6.1-5	192.0 kB	768.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.6.1-5	202.3 kB	846.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.6.1-4	230.2 kB	1,241.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.6.1-5	180.2 kB	758.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.6.1-5	191.4 kB	1,005.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.6.1-5	195.6 kB	986.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.6.1-5	197.3 kB	986.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.6.1-5	196.9 kB	698.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.6.1-5	198.9 kB	794.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.6.1-5	231.0 kB	982.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.6.1-5	182.6 kB	4,445.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.6.1-5	199.5 kB	802.0 kB	[ファイル一覧]