Paket: primer3 (2.6.1-5 und andere)

[ Quellcode: primer3  ]

tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification

Primer3 picks primers for Polymerase Chain Reactions (PCRs), considering as criteria oligonucleotide melting temperature, size, GC content and primer-dimer possibilities, PCR product size, positional constraints within the source sequence, and miscellaneous other constraints. All of these criteria are user-specifiable as constraints, and some are specifiable as terms in an objective function that characterizes an optimal primer pair.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu primer3

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• sug: ncbi-epcr

  Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites

• enh: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

primer3 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	194,9 kB	986,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.6.1-5	199,2 kB	806,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.6.1-5	182,3 kB	922,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.6.1-5	188,0 kB	790,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.6.1-5	180,0 kB	666,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	192,0 kB	768,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.6.1-5	202,3 kB	846,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.6.1-4	230,2 kB	1.241,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	189,4 kB	791,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	180,2 kB	758,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.6.1-5	191,4 kB	1.005,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	195,6 kB	986,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.6.1-5	197,3 kB	986,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.6.1-5	196,9 kB	698,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.6.1-5	198,9 kB	794,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	231,0 kB	982,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	182,6 kB	4.445,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.6.1-5	199,5 kB	802,0 kB	[Liste der Dateien]