パッケージ: primer3 (2.4.0-4)

[ ソース: primer3  ]

tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification

Primer3 picks primers for Polymerase Chain Reactions (PCRs), considering as criteria oligonucleotide melting temperature, size, GC content and primer-dimer possibilities, PCR product size, positional constraints within the source sequence, and miscellaneous other constraints. All of these criteria are user-specifiable as constraints, and some are specifiable as terms in an objective function that characterizes an optimal primer pair.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の primer3 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• sug: ncbi-epcr

  Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites

• enh: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

primer3 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	177.0 kB	699.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	160.9 kB	627.0 kB	[ファイル一覧]
armel	167.6 kB	671.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	161.8 kB	571.0 kB	[ファイル一覧]
i386	179.3 kB	719.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	174.2 kB	726.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	174.7 kB	709.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	174.6 kB	827.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	160.0 kB	659.0 kB	[ファイル一覧]