[ ソース: hmmer2 ]
パッケージ: hmmer2 (2.3.2+dfsg-8)
hmmer2 に関するリンク
Debian の資源:
hmmer2 ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [hmmer.janelia.org]
類似のパッケージ:
タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル
HMMER は、プロファイル隠れマルコフモデル法の実装であり、多重配列アライメン トをクエリー (問い合わせ) として用いた生物学配列データベースの感度の高い検 索を行うためのものです。
入力として多重配列アライメントを与えると、HMMER は "隠れマルコフモデル" と 呼ばれる統計モデルを構築します。このモデルをさらにクエリーとして、配列デー タベースから、配列ファミリの追加のホモログ (相同体) を検索する (またはアラ イメントする) ことができます。
その他の hmmer2 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libsquid1 (>= 1.9g+cvs20050121)
- biosquid dynamic library for biological sequence analysis
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- rec: biosquid
- utilities for biological sequence analysis
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- sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-8)
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)
hmmer2 のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 307.3 kB | 2,169.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 279.6 kB | 2,387.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 271.5 kB | 2,383.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 271.5 kB | 1,807.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 313.0 kB | 2,495.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 305.9 kB | 2,461.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 302.4 kB | 2,447.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 309.3 kB | 2,965.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 287.9 kB | 2,242.0 kB | [ファイル一覧] |