パッケージ: exonerate (2.4.0-5 など)
exonerate に関するリンク
Debian の資源:
exonerate ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Steffen Moeller (QA ページ)
- Charles Plessy (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [www.ebi.ac.uk]
類似のパッケージ:
generic tool for pairwise sequence comparison
Exonerate allows you to align sequences using a many alignment models, using either exhaustive dynamic programming, or a variety of heuristics. Much of the functionality of the Wise dynamic programming suite was reimplemented in C for better efficiency. Exonerate is an intrinsic component of the building of the Ensembl genome databases, providing similarity scores between RNA and DNA sequences and thus determining splice variants and coding sequences in general.
An In-silico PCR Experiment Simulation System (see the ipcress man page) is packaged with exonerate.
This package also comes with a selection of utilities for performing simple manipulations quickly on fasta files beyond 2Gb
その他の exonerate 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)
- C ルーチンの GLib ライブラリ
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- sug: wise
- DNA 配列とタンパク質配列のような生体高分子の比較
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- enh: bioperl-run
- BioPerl wrappers: scripts
exonerate のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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alpha (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 2,093.4 kB | 11,018.0 kB | [ファイル一覧] |
amd64 | 2.4.0-5+b1 | 1,917.3 kB | 9,639.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 2.4.0-5+b1 | 1,724.5 kB | 10,163.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 2.4.0-5+b1 | 1,541.5 kB | 9,362.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 2.4.0-5+b1 | 1,622.2 kB | 6,434.0 kB | [ファイル一覧] |
hppa (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 2,026.8 kB | 9,361.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 2.4.0-5+b1 | 2,028.0 kB | 10,410.0 kB | [ファイル一覧] |
ia64 (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 2,608.5 kB | 22,832.0 kB | [ファイル一覧] |
m68k (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 1,764.0 kB | 9,098.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 2.4.0-5+b1 | 1,728.5 kB | 11,371.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 1,775.7 kB | 12,787.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 2.4.0-5+b1 | 1,793.6 kB | 12,595.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 | 2.4.0-5+b2 | 1,963.4 kB | 8,123.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 2.4.0-5+b1 | 2,233.5 kB | 11,559.0 kB | [ファイル一覧] |
sh4 (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 2,336.3 kB | 8,698.0 kB | [ファイル一覧] |
sparc64 (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 1,673.3 kB | 34,221.0 kB | [ファイル一覧] |
x32 (非公式の移植版) | 2.4.0-5+b1 | 1,878.4 kB | 9,590.0 kB | [ファイル一覧] |