[ ソース: r-bioc-variantannotation ]
パッケージ: r-bioc-variantannotation (1.36.0-1)
r-bioc-variantannotation に関するリンク
Debian の資源:
r-bioc-variantannotation ソースパッケージをダウンロード:
- [r-bioc-variantannotation_1.36.0-1.dsc]
- [r-bioc-variantannotation_1.36.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-variantannotation_1.36.0-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
BioConductor annotation of genetic variants
This BioConductor package provides R functions to annotate variants, compute amino acid coding changess and to predict coding outcomes.
その他の r-bioc-variantannotation 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.15) [arm64, ppc64el 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
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- dep: libcurl4 (>= 7.18.0)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.12
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
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- dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)
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- dep: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.57.2)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
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- dep: r-bioc-matrixgenerics
- S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects
-
- dep: r-bioc-rhtslib
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
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- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.0)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
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- dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.19.5)
- BioConductor assay container
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
-
- dep: r-cran-dbi
- GNU R package providing a generic database interface
-
- rec: r-bioc-snpstats
- BioConductor SnpMatrix and XSnpMatrix classes and methods
-
- rec: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- GNU R client to access AnnotationHub resources
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
r-bioc-variantannotation のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 3,419.3 kB | 4,819.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 3,399.3 kB | 4,787.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 3,387.1 kB | 4,736.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 3,388.9 kB | 4,604.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 3,394.8 kB | 4,832.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 3,406.0 kB | 4,898.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 3,409.2 kB | 4,859.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 3,447.3 kB | 5,039.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 3,407.1 kB | 4,867.0 kB | [ファイル一覧] |