Pakiet: probcons (1.12-13)

[ Pakiet źródłowy: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z probcons

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]

• sug: probcons-extra

  Extra programs from the probcons package

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie probcons

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	116,1 KiB	375,0 KiB	[lista plików]
arm64	108,4 KiB	326,0 KiB	[lista plików]
armel	104,4 KiB	345,0 KiB	[lista plików]
armhf	102,5 KiB	253,0 KiB	[lista plików]
i386	101,3 KiB	365,0 KiB	[lista plików]
mips64el	128,4 KiB	408,0 KiB	[lista plików]
mipsel	125,9 KiB	413,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	135,3 KiB	415,0 KiB	[lista plików]
s390x	99,6 KiB	374,0 KiB	[lista plików]