Paquet : pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2)

[ Paquet source : pbsim  ]

simulateur pour les lectures de séquences de PacBio

Les séquenceurs d’ADN PacBio produisent deux types de lectures caractéristiques : CSS (courtes et taux d’erreur bas) et CLR (longues et taux d’erreur haut), tous deux pouvant être utiles pour les assemblages de novo de génomes. PBSIM simule de telles lectures PacBio à partir d’une séquence de référence en utilisant soit une simulation basée sur un modèle ou basé un échantillonnage. Les lectures simulées sont utiles, par exemple, lors du développement ou l’évaluation d’assembleurs de séquences destinés aux données de PacBio.

Étiquettes: Biologie: Acides nucléiques, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rôle: Programme, But: use::simulating, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à pbsim

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

Télécharger pbsim

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	25,0 ko	97,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	24,2 ko	93,0 ko	[liste des fichiers]
armel	24,6 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	24,1 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
i386	26,0 ko	100,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	25,5 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	26,0 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	26,7 ko	121,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	23,7 ko	93,0 ko	[liste des fichiers]