パッケージ: r-bioc-rsamtools (2.14.0-1)

[ ソース: r-bioc-rsamtools  ]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

その他の r-bioc-rsamtools 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libcurl4 (>= 7.18.0)

  使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-bitops

  GNU R package implementing bitwise operations

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

  GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

r-bioc-rsamtools のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	3,667.0 kB	5,744.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3,623.2 kB	5,696.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3,594.5 kB	5,629.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3,599.6 kB	5,373.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3,712.8 kB	5,897.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3,623.9 kB	5,946.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	3,638.2 kB	5,876.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3,711.2 kB	6,144.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3,626.6 kB	5,828.0 kB	[ファイル一覧]