Package: snap-aligner (2.0.3+dfsg-2)

[ Source: snap-aligner  ]

programma scalabile per allineamento di nucleotidi

SNAP (Scalable Nucleotide Alignment Program) è un nuovo allineatore di sequenze che è da 3 a 20 volte più veloce, e altrettanto accurato, rispetto agli strumenti esistenti come BWA-mem, Bowtie2 e Novoalign. Gira su normali processori x86 e gestisce un ricco modello di errori che gli permette con poco sforzo di trovare corrispondenze per letture con più differenze rispetto a quelle di riferimento, di quanto non facciano altri strumenti. Questo dà a SNAP un tasso di errore fino a due volte inferiore agli strumenti esistenti (in certi casi) e gli permette di trovare corrispondenze in caso di mutazioni più ampie che essi potrebbero non trovare. Inoltre SNAP legge nativamente BAM, FASTQ o FASTQ compresso con gzip, e scrive nativamente SAM o BAM, con ordinamento incorporato, marcatura di duplicati e indicizzazione BAM.

Other Packages Related to snap-aligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	812.7 kB	2,544.0 kB	[list of files]