Package: snap-aligner (2.0.3+dfsg-2)
Links for snap-aligner
Debian Resources:
Download Source Package snap-aligner:
- [snap-aligner_2.0.3+dfsg-2.dsc]
- [snap-aligner_2.0.3+dfsg.orig.tar.xz]
- [snap-aligner_2.0.3+dfsg-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
External Resources:
- Homepage [snap.cs.berkeley.edu]
Similar packages:
programma scalabile per allineamento di nucleotidi
SNAP (Scalable Nucleotide Alignment Program) è un nuovo allineatore di sequenze che è da 3 a 20 volte più veloce, e altrettanto accurato, rispetto agli strumenti esistenti come BWA-mem, Bowtie2 e Novoalign. Gira su normali processori x86 e gestisce un ricco modello di errori che gli permette con poco sforzo di trovare corrispondenze per letture con più differenze rispetto a quelle di riferimento, di quanto non facciano altri strumenti. Questo dà a SNAP un tasso di errore fino a due volte inferiore agli strumenti esistenti (in certi casi) e gli permette di trovare corrispondenze in caso di mutazioni più ampie che essi potrebbero non trovare. Inoltre SNAP legge nativamente BAM, FASTQ o FASTQ compresso con gzip, e scrive nativamente SAM o BAM, con ordinamento incorporato, marcatura di duplicati e indicizzazione BAM.
Other Packages Related to snap-aligner
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.0)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
- libreria di compressione - runtime
Download snap-aligner
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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mips64el | 812.7 kB | 2,544.0 kB | [list of files] |