Pakiet: snap-aligner (2.0.3+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: snap-aligner  ]

Scalable Nucleotide Alignment Program

SNAP is a new sequence aligner that is 3-20x faster and just as accurate as existing tools like BWA-mem, Bowtie2 and Novoalign. It runs on commodity x86 processors, and supports a rich error model that lets it cheaply match reads with more differences from the reference than other tools. This gives SNAP up to 2x lower error rates than existing tools (in some cases) and lets it match larger mutations that they may miss. SNAP also natively reads BAM, FASTQ, or gzipped FASTQ, and natively writes SAM or BAM, with built-in sorting, duplicate marking, and BAM indexing.

Inne pakiety związane z snap-aligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie snap-aligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
mips64el	812,7 KiB	2 544,0 KiB	[lista plików]