Package: mash (2.3+dfsg-6 and others)
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Maintainers:
External Resources:
- Homepage [mash.readthedocs.io]
Similar packages:
veloce stima di distanze in genoma e metagenoma usando MinHash
Mash usa gli hash MinHash sensibili localmente per ridurre grandi biosequenze in sketch rappresentativi e stimare rapidamente le distanze di coppia tra genomi o metagenomi. I database di sketch di Mash delineano in maniera efficace i confini conosciuti tra le specie, permettono la costruzione di filogenie approssimate e possono essere cercati in secondi usando genomi assemblati o risultati grezzi di sequenziamento da Illumina, Pacific Biosciences e Oxford Nanopore. Per la metagenomica, Mash scala fino a migliaia di campioni e può replicare i risultati dello Human Microbiome Project e del Global Ocean Survey in una frazione del tempo.
Other Packages Related to mash
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libcapnp-1.1.0
- libreria C++ Cap'n Proto
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not riscv64]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
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- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)
- GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
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- dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)
- Portable MurmurHash Implementation
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download mash
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 2.3+dfsg-6+b2 | 187.5 kB | 538.0 kB | [list of files] |
arm64 | 2.3+dfsg-6+b2 | 165.3 kB | 490.0 kB | [list of files] |
mips64el | 2.3+dfsg-6+b2 | 167.6 kB | 635.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 2.3+dfsg-6+b2 | 184.5 kB | 618.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 2.3+dfsg-6+b3 | 185.7 kB | 402.0 kB | [list of files] |
s390x | 2.3+dfsg-6+b2 | 187.2 kB | 546.0 kB | [list of files] |