Package: libhts-dev (1.20+ds-2)
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- Andreas Tille (QA Page)
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- Steffen Moeller (QA Page)
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External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
file di sviluppo per HTSlib
HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.
HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.
Questo pacchetto contiene i file di sviluppo per HTSlib: header, libreria statica, pagine di manuale, ecc.
Per compatibilità con sambamba, è stata esportata la routine interna cram_to_bam, adottando qui una patch che si trova in guix.
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Download libhts-dev
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1,660.8 kB | 7,060.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1,588.0 kB | 6,753.0 kB | [list of files] |
| armel | 1,582.6 kB | 5,006.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1,586.6 kB | 4,748.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1,653.4 kB | 5,038.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1,684.3 kB | 7,402.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1,693.1 kB | 7,167.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 3,007.8 kB | 30,464.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1,623.0 kB | 6,842.0 kB | [list of files] |