Package: libhts-dev (1.20+ds-1)
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Maintainers:
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- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
file di sviluppo per HTSlib
HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.
HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.
Questo pacchetto contiene i file di sviluppo per HTSlib: header, libreria statica, pagine di manuale, ecc.
Per compatibilità con sambamba, è stata esportata la routine interna cram_to_bam, adottando qui una patch che si trova in guix.
Other Packages Related to libhts-dev
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Download libhts-dev
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1,644.3 kB | 6,991.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1,574.9 kB | 6,690.0 kB | [list of files] |
| armel | 1,567.6 kB | 4,968.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1,573.5 kB | 4,703.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1,635.3 kB | 4,976.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1,667.1 kB | 7,334.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1,678.9 kB | 7,106.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 2,968.2 kB | 29,968.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1,610.1 kB | 6,822.0 kB | [list of files] |