Paket: libhts-dev (1.20+ds-1 und andere)
Links für libhts-dev
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket htslib herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate - Entwicklungsdateien
HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.
HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.
Dieses Paket enthält Entwicklungsdateien für die HTSlib: Header, statische Bibliothek, Handbuchseiten, etc.
Aus Gründen der Kompatibilität mit sambamba wurde die interne Routine cram_to_bam exportiert, wobei ein in guix gefundener Patch übernommen wurde.
Andere Pakete mit Bezug zu libhts-dev
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libhts-dev herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.20+ds-1+b1 | 1.661,8 kB | 7.061,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 1.20+ds-1 | 1.574,9 kB | 6.690,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 1.20+ds-1+b1 | 1.582,1 kB | 5.007,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 1.20+ds-1+b1 | 1.586,7 kB | 4.749,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 1.20+ds-1+b1 | 1.651,2 kB | 5.039,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 1.20+ds-1+b1 | 1.685,0 kB | 7.403,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 1.20+ds-1+b1 | 1.693,9 kB | 7.168,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 1.20+ds-1+b1 | 3.000,4 kB | 30.465,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 1.20+ds-1+b1 | 1.622,9 kB | 6.843,0 kB | [Liste der Dateien] |