Paket: libhts-dev (1.21+ds-1)
Links für libhts-dev
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket htslib herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate - Entwicklungsdateien
HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.
HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.
Dieses Paket enthält Entwicklungsdateien für die HTSlib: Header, statische Bibliothek, Handbuchseiten, etc.
Aus Gründen der Kompatibilität mit sambamba wurde die interne Routine cram_to_bam exportiert, wobei ein in guix gefundener Patch übernommen wurde.
Andere Pakete mit Bezug zu libhts-dev
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libhts-dev herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1.692,0 kB | 7.225,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 1.619,1 kB | 6.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 1.614,2 kB | 5.133,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 1.617,9 kB | 4.862,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 1.684,1 kB | 5.140,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 1.714,2 kB | 7.551,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 1.727,1 kB | 7.324,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 3.062,4 kB | 30.975,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 1.651,6 kB | 6.991,0 kB | [Liste der Dateien] |