Package: ipig (0.0.r5-5)

[ Source: ipig  ]

integrazione di PSM con la visualizzazione con browser genomici

iPiG ha come obiettivo l'integrazione di PSM (Peptide Spectrum Match, corrispondenza di spettro di peptide) da identificazione di peptidi con spettrometria di massa (MS) in visualizzazioni genomiche fornite da navigatori di genomi come il navigatore di genomi UCSC (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG prende PSM nel formato standard per MS mzIdentML (*.mzid) o in formato testuale e fornisce i risultati nei formati per tracce genomici (file BED e GFF3) che possono essere facilmente importati in navigatori di genomi.

Other Packages Related to ipig

• dep: libcommons-compress-java

  API Java per lavorare con i formati di compressione e archiviazione

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - API client Java per protocolli Internet di base

• dep: libjdom1-java

  libreria leggera e veloce che usa XML

• dep: libxerces2-java

  analizzatore XML di validazione per Java con gestione del livello 3 di DOM

Download ipig

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
arm64	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
armel	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
armhf	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
i386	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
mips64el	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
ppc64el	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
riscv64	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]
s390x	164.3 kB	189.0 kB	[list of files]