Balík: ipig (0.0.r5-5)

[ Zdroj: ipig  ]

integrating PSMs into genome browser visualisations

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  odľahčená a rýchla knižnica používajúca XML

• dep: libxerces2-java

  overujúci XML parser pre Javy s podporou DOM level 3

Stiahnuť ipig

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
armel	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
i386	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	164.3 kB	189.0 kB	[zoznam súborov]