Package: murasaki-common (1.68.6-13)

[ Source: murasaki  ]

strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (file comuni)

Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.

Murasaki è un software per allineamento ad ancore, che è

 * estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con
   40 nodi: 52 minuti di orologio))
 * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche
   un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.)
 * con lunghezza illimitata dei modelli
 * tollerante alle ripetizioni
 * con riduzione intelligente del rumore

Questo pacchetto contiene tutti i file che sono comuni al pacchetto per core singolo murasaki e al pacchetto per core multipli murasaki-mpi.

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  Package not available

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Download murasaki-common

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	141.9 kB	433.0 kB	[list of files]