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Package: autodock (4.2.6-9 and others)

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analisi dei legami dei ligandi alla struttura di una proteina

AutoDock è un rappresentante di spicco dei programmi che si occupano della simulazione dell'aggancio di ligandi chimici piuttosto piccoli a recettori proteici piuttosto grandi. Le versioni precedenti avevano tutta la flessibilità nei ligandi, mentre la proteina era mantenuta piuttosto rigida. Questa ultima versione 4 permette anche la flessibilità di catene laterali selezionate di residui superficiali, cioè tiene in considerazione i rotameri.

Il programma AutoDock esegue l'aggancio del ligando ad una serie di griglie che descrivono la proteina bersaglio. AutoGrid pre-calcola queste griglie.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

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armel 4.2.6-9 156.7 kB403.0 kB [list of files]
armhf 4.2.6-9 151.7 kB315.0 kB [list of files]
i386 4.2.6-9 161.5 kB411.0 kB [list of files]
mips64el 4.2.6-9 165.0 kB460.0 kB [list of files]
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s390x 4.2.6-9 149.3 kB395.0 kB [list of files]