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Package: bioawk (1.0-5)

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estensione di awk per analisi di sequenze biologiche

Bioawk è un'estensione di awk di Brian Kernighan che aggiunge la gestione di diversi formati di dati biologici comuni, inclusi BED, GFF, SAM, VCF, FASTA/Q e formati delimitati da tabulazione, opzionalmente compressi con gzip. Aggiunge anche alcune funzioni incorporate e un'opzione per la riga di comando per usare TAB come delimitatore nell'input/output. Quando non viene usata la nuova funzionalità, bioawk è pensato per comportarsi esattamente come l'originale BWK awk.

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