Paquet : bioawk (1.0-5)

[ Paquet source : bioawk  ]

extension d’awk pour l’analyse de séquences biologiques

Bioawk est une extension du awk de Brian Kernighan, ajoutant la prise en charge de plusieurs formats communs de données de biologie, incluant les formats facultativement compressés par gzip, BED, GFF, SAM, VCF, FASTA/Q et délimités par des tabulations avec des noms de colonne. Il ajoute des fonctions internes et une option en ligne de commande pour utiliser les tabulations comme délimiteurs d’entrée/sortie. Quand cette nouvelle fonctionnalité n’est pas utilisée, bioawk est prévu pour se comporter comme l’awk originel de Brian Wilson Kernighan.

Autres paquets associés à bioawk

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger bioawk

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	55,7 ko	163,0 ko	[liste des fichiers]