Package: augur (24.4.0-1)

[ Source: augur  ]

componenti della catena di elaborazione di dati per analisi in tempo reale di virus

Il progetto nextstrain è un tentativo di creare strumenti di visualizzazione e catene di elaborazione di dati informatici flessibili per tenere traccia dell'evoluzione in corso di patogeni mano a mano che emergono i dati delle sequenze. Il progetto nextstrain deriva da nextflu, che era specifico per l'evoluzione dell'influenza.

nextstrain è composto da tre componenti:

  * fauna: database e script di IO per dati seriologici e di sequenze;
  * augur: catene di elaborazione di dati informatiche per fare inferenza
    da dati grezzi;
  * auspice: applicazione web per visualizzare le inferenze risultanti.

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