Package: adapterremoval (2.3.3-3 and others)

[ Source: adapterremoval  ]

identificazione e taglio di adattatore e unione di letture di sequenze geniche veloci

Questo programma cerca e rimuove sequenze adattatrici rimanenti da dati di sequenziamento ad alta processività (HTS, High-Throughput Sequencing) e (opzionalmente) taglia basi di bassa qualità dall'estremità 3' delle letture dopo la rimozione dell'adattatore. AdapterRemoval può analizzare sia dati a estremità singole e accoppiate e può essere utilizzato per unire letture a estremità accoppiate sovrapposte in sequenze di consenso (più lunghe). In aggiunta, AdapterRemoval può essere utilizzato per recuperare una sequenza adattatrice di consenso da dati ad estremità accoppiate per i quali questa informazione non è disponibile.

Other Packages Related to adapterremoval

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, riscv64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.3.3-3	196.3 kB	566.0 kB	[list of files]
arm64	2.3.3-3+b1	169.1 kB	551.0 kB	[list of files]
armel	2.3.3-3	157.3 kB	473.0 kB	[list of files]
armhf	2.3.3-3	163.6 kB	353.0 kB	[list of files]
i386	2.3.3-3	203.0 kB	565.0 kB	[list of files]
mips64el	2.3.3-3	169.8 kB	636.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.3.3-3	191.0 kB	614.0 kB	[list of files]
riscv64	2.3.3-3	179.8 kB	402.0 kB	[list of files]
s390x	2.3.3-3	181.1 kB	538.0 kB	[list of files]