Package: adapterremoval (2.3.3-3 and others)

[ Source: adapterremoval  ]

identificazione e taglio di adattatore e unione di letture di sequenze geniche veloci

Questo programma cerca e rimuove sequenze adattatrici rimanenti da dati di sequenziamento ad alta processività (HTS, High-Throughput Sequencing) e (opzionalmente) taglia basi di bassa qualità dall'estremità 3' delle letture dopo la rimozione dell'adattatore. AdapterRemoval può analizzare sia dati a estremità singole e accoppiate e può essere utilizzato per unire letture a estremità accoppiate sovrapposte in sequenze di consenso (più lunghe). In aggiunta, AdapterRemoval può essere utilizzato per recuperare una sequenza adattatrice di consenso da dati ad estremità accoppiate per i quali questa informazione non è disponibile.

Other Packages Related to adapterremoval

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64, ia64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download adapterremoval

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.3.3-3	171.6 kB	616.0 kB	[list of files]
amd64	2.3.3-3	196.3 kB	566.0 kB	[list of files]
arm64	2.3.3-3+b1	169.1 kB	551.0 kB	[list of files]
armel	2.3.3-3	157.3 kB	473.0 kB	[list of files]
armhf	2.3.3-3	163.6 kB	353.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.3.3-3	171.8 kB	481.0 kB	[list of files]
i386	2.3.3-3	203.0 kB	565.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.3.3-2	231.5 kB	1,062.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.3.3-3	179.4 kB	525.0 kB	[list of files]
mips64el	2.3.3-3	169.8 kB	636.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.3.3-3	185.7 kB	678.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.3.3-3	191.0 kB	614.0 kB	[list of files]
riscv64	2.3.3-3	179.8 kB	402.0 kB	[list of files]
s390x	2.3.3-3	181.1 kB	538.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.3.3-3	213.2 kB	486.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.3.3-3	148.6 kB	1,066.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.3.3-3	196.9 kB	533.0 kB	[list of files]