Package: bowtie (1.0.1-2) [debports]

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allineatore di letture brevi ultraveloce ed efficiente in termini di memoria

Questo pacchetto affronta il problema di interpretare i risultati delle più recenti (2010) tecnologie di sequenziamento del DNA. Esse restituiscono pezzi piuttosto corti che non possono essere interpretate direttamente. La sfida per gli strumenti come Bowtie è quella di fornire una posizione nei cromosomi per i brevi frammenti di DNA sequenziati in ogni corsa.

Bowtie allinea sequenze (letture) brevi di DNA al genoma umano a una velocità di oltre 25 milioni di 35 bp all'ora. Bowtie indicizza il genoma con un indice Burrows-Wheeler per mantenere piccola la propria impronta di memoria: tipicamente circa 2,2 GB per il genoma umano (2,9 GB per le estremità accoppiate).

Other Packages Related to bowtie

• dep: libc6 (>= 2.16)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1

  Package not available

• dep: libstdc++6

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: bowtie-examples

  esempi per bowtie, l'allineatore di letture brevi ultraveloce ed efficiente in termini di memoria

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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