Package: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 and others) [debports]

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mappatore Quantitative Trait Loci (QTL) in cis per fenotipi molecolari

L'obiettivo di FastQTL è di identificare polimorfismi a nucleotide singolo (SNP) che sono associati in maniera significativa a vari fenotipi molecolari (cioè espressioni di geni conosciuti, livelli di metilazione della citosina, ecc.). Esegue scansioni per tutte le possibili coppie fenotipo-variante in cis (cioè varianti localizzate all'interno di una finestra specifica intorno a un fenotipo). FastQTL implementa un nuovo schema di permutazione (approssimazione Beta) per correggere accuratamente e velocemente test multipli sia a livello di genotipo sia di fenotipo.

Other Packages Related to fastqtl

• dep: libblas3

  implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  libreria Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

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  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8)

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• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

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• dep: libstdc++6 (>= 14)

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• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

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• rec: r-cran-argparser

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• rec: r-cran-qvalue

  Package not available

• rec: r-cran-tools

  Package not available

• sug: fastqtl-doc

  mappatore QTL in cis per fenotipi molecolari - documentazione

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	2.184+v7+dfsg-4+b3	177.3 kB	1,116.0 kB	[list of files]