Balík: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 a iné) [debports]

[ Zdroj:  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom fastqtl

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  podporná knižnica GCC

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8)

  GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice blas

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib (>= 4.4.1)

  GNU R standalone mathematics library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Balík nie je dostupný

• rec: r-cran-tools

  Balík nie je dostupný

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Stiahnuť fastqtl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
sparc64 (neoficiálny port)	2.184+v7+dfsg-4+b3	177.3 kB	1,116.0 kB	[zoznam súborov]