[ Source: circlator ]
Package: circlator (1.5.6-12)
Links for circlator
Debian Resources:
Download Source Package circlator:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [sanger-pathogens.github.io]
Similar packages:
circolarizza assemblati genomici
Circlator è uno strumento per automatizzare la circolarizzazione di assemblati per genomi batterici e piccoli genomi eucariotici, e produce rappresentazioni lineari accurate di sequenze circolari.
Other Packages Related to circlator
|
|
|
|
-
- dep: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
-
- dep: canu
- assemblatore di sequenze di molecole singole per genomi
-
- dep: fastaq
- strumenti per manipolare file FASTA e FASTQ
-
- dep: mummer
- Allineamento efficiente di sequenze di genomi completi
-
- dep: prodigal
- programma per trovare geni microbici (di batteri e archei)
-
- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
-
- dep: python3-openpyxl
- modulo Python 3 per leggere e scrivere file OpenXML xlsx/xlsm
-
- dep: python3-packaging
- utilità principali per pacchetti Python 3
-
- dep: python3-pymummer
- interfaccia Python 3 per MUMmer
-
- dep: python3-pysam
- interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)
-
- dep: samtools
- elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM
-
- rec: spades
- assemblatore di genomi per singola-cellula e insiemi di dati di isolati
Download circlator
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 4,496.3 kB | 11,642.0 kB | [list of files] |