Package: python3-vcf (0.6.8+git20170215.476169c-11 and others)

[ Source: python-pyvcf  ]

analizzatore di Variant Call Format (VCF) per Python 3

Variant Call Format (VCF) specifica il formato di un file di testo usato in bioinformatica per memorizzare variazioni di sequenze di geni. Il formato è stato sviluppato con l'avvento di progetti di sequenziamento di DNA e di genotipizzazione su larga scala, come il 1000 Genomes Project.

L'intento di questo modulo è di imitare il modulo "csv" nella stdlib di Python, in contrasto con formati più flessibili di serializzazione come JSON o YAML. "vcf" tenterà di analizzare il contenuto di ogni record sulla base dei tipi di dato specificati nelle righe di meta-informazioni, e precisamente le righe ##INFO e ##FORMAT. Se tali righe sono mancanti o incomplete, controllerà i tipi riservati menzionati nelle specifiche. In mancanza di ciò, restituirà semplicemente delle stringhe.

Questo pacchetto fornisce i moduli per Python 3.

Other Packages Related to python3-vcf

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [not hppa, ia64, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (<< 3.9) [hppa, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [not hppa, ia64, ppc64, sparc64]

  dep: python3 (>= 3.7~) [hppa, ppc64, sparc64]

• dep: python3-pkg-resources [hppa, ia64, ppc64, sparc64]

  rilevazione di pacchetti e accesso a risorse usando pkg_resources

• dep: python3-pysam [not hppa, ppc64, sparc64]

  interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)

Download python3-vcf

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-11	58.0 kB	362.0 kB	[list of files]
amd64	0.6.8+git20170215.476169c-11	59.8 kB	264.0 kB	[list of files]
arm64	0.6.8+git20170215.476169c-11	54.1 kB	232.0 kB	[list of files]
armel	0.6.8+git20170215.476169c-11	52.8 kB	226.0 kB	[list of files]
armhf	0.6.8+git20170215.476169c-11	53.4 kB	190.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-3	56.8 kB	229.0 kB	[list of files]
i386	0.6.8+git20170215.476169c-11	59.0 kB	250.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-10	59.6 kB	274.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-11	53.0 kB	214.0 kB	[list of files]
mips64el	0.6.8+git20170215.476169c-11	54.2 kB	302.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-3	57.4 kB	361.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.6.8+git20170215.476169c-11	60.4 kB	360.0 kB	[list of files]
riscv64	0.6.8+git20170215.476169c-11	57.6 kB	216.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-11	61.9 kB	230.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-3	53.4 kB	237.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.6.8+git20170215.476169c-11	60.9 kB	250.0 kB	[list of files]