Package: libbio-samtools-perl (1.43-5 and others)

[ Source: libbio-samtools-perl  ]

interfaccia Perl alla libreria SamTools per sequenziamento di DNA

Bio::SamTools fornisce un'interfaccia Perl alla libreria libbam per database di allineamenti di sequenze SAM/BAM indicizzati e non indicizzati. Fornisce il supporto per il recupero di informazioni su allineamenti singoli, coppie di letture e informazioni sulla copertura degli allineamenti su grandi regioni. Fornisce anche funzionalità di callback per rilevare SNP ed effettuare altre funzioni base-per-base. La maggior parte delle operazioni è compatibile con l'interfaccia BioPerl Bio::SeqFeatureI, permettendo di utilizzare file BAM come backend per l'applicazione per navigazione di genomi GBrowse.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library, Shared Library

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• dep: perlapi-5.40.0

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	1.43-5+b1	184.7 kB	743.0 kB	[list of files]