Package: macsyfinder (2.1.4-1)

[ Source: macsyfinder  ]

rilevamento di sistemi macromolecolari in insiemi di dati di proteine

MacSyFinder è un programma per modellare e rilevare sistemi macromolecolari, percorsi genetici, ... in insiemi di dati di proteine. Nei procarioti, questi sistemi hanno spesso proprietà che si conservano nell'evoluzione: sono costituiti da componenti conservati e sono codificati in loci compatti (architettura genetica conservata). L'utente modella questi sistemi con MacSyFinder per rispecchiare queste proprietà conservate, e per permettere la loro rilevazione efficiente.

Questo pacchetto presenta l'API Java open source per i database biologici e una serie di algoritmi, la maggior parte basati su sequenze.

Other Packages Related to macsyfinder

• dep: hmmer

  profilamento di modelli di Markov nascosti per analisi di sequenze proteiche

• dep: libjs-jquery (>= 3.6.0)

  libreria JavaScript per applicazioni web dinamiche

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 7.4)

  supporto JavaScript per la documentazione di Sphinx

• dep: libjs-underscore

  libreria ausiliaria per programmazione funzionale di JavaScript

• dep: ncbi-blast+

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-certifi

  certificati radice per validare certificati SSL e verificare host TLS (Python 3)

• dep: python3-colorama

  testo colorato su terminale multi-piattaforma per Python - Python 3.x

• dep: python3-colorlog

  strumento di formattazione per l'uso con il modulo di log di Python 3

• dep: python3-networkx

  strumento per creare, manipolare e studiare reti complesse (Python 3)

• dep: python3-packaging

  utilità principali per pacchetti Python 3

• dep: python3-pandas

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: python3-yaml

  analizzatore ed emettitore YAML per Python 3

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 2.0.0+dfsg)

  tema sphinx da readthedocs.org (file comuni)

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	14,200.2 kB	37,593.0 kB	[list of files]
arm64	14,201.6 kB	37,593.0 kB	[list of files]
i386	14,201.1 kB	37,593.0 kB	[list of files]