Package: iqtree (2.0.7+dfsg-1 and others)

[ Source: iqtree  ]

efficiente software filogenetico per massima verosimiglianza

IQ-TREE è un software filogenetico molto efficiente per massima verosimiglianza con le seguenti funzionalità chiave, tra le altre:

 * un innovativo algoritmo stocastico veloce ed efficace per stimare
   alberi di massima verosimiglianza; IQ-TREE supera in prestazioni sia
   RAxML sia PhyML in termini di verosimiglianza richiedendo al contempo
   una simile quantità di tempo di calcolo (vedere Nguyen et al., 2015);
 * un'approssimazione bootstrap ultraveloce per determinare i supporti
   dei rami (vedere Minh et al., 2013).
 * un'ampia gamma di modelli di sostituzione per allineamenti per binari,
   DNA, proteine, codoni e morfologici;
 * selezione ultraveloce del modello per tutti i tipi di dati, da 10 a 100
   volte più veloce di jModelTest e ProtTest;
 * ricerca del miglior schema di partizione come PartitionFinder;
 * modelli partizionati con tipi misti di dati per allineamenti
   filogenomici (multi-gene), permettendo lunghezze dei rami tra i geni
   separate, proporzionali o unite;
 * compatibile con PLL (Phylogenetic Likelihod Library) (vedere Flouri et
   al., 2014).

Other Packages Related to iqtree

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [amd64]

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [i386]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [amd64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.0.7+dfsg-1+b2	3,566.8 kB	25,632.0 kB	[list of files]
i386	2.0.7+dfsg-1+b2	3,153.6 kB	22,295.0 kB	[list of files]