Package: maq (0.7.1-9) [debports]

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mappatura di corte sequenze di lunghezza fissa di DNA polimorfo su sequenze di riferimento

Maq (abbreviazione di Mappatura e Assemblaggio con Qualità) costruisce assemblaggi per mappatura a partire da corte letture generate dalle apparecchiature di sequenziamento di seconda generazione. È pensato principalmente per l'analizzatore Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer ed ha una preliminare capacità di gestire dati ABI SOLiD. Maq si chiamava prima mapass2.

Lo sviluppo di Maq si è fermato nel 2008. I suoi successori sono BWA e SAMtools.

Other Packages Related to maq

• dep: libc6.1 (>= 2.31)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	329.5 kB	752.0 kB	[list of files]