Package: r-bioc-rtracklayer (1.62.0-1) [debports]

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interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

Infrastruttura estensibile per interagire con più navigatori di genomi (attualmente incorporato UCSC) e manipolare tracce di annotazioni in vari formati (attualmente incorporati GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig e 2bit). L'utente può esportare e importare tracce verso e dai navigatori gestiti, così come interrogare e modificare lo stato del navigatore, come l'attuale porzione visualizzata.

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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  Package not available

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• dep: r-bioc-biocio

  standard input and output for Bioconductor packages

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  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

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  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.37.2)

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• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)

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• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

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• dep: r-bioc-zlibbioc

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• dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2)

  interfaccia client generica di rete (HTTP/FTP/...) per GNU R

• dep: r-cran-restfulr (>= 0.0.13)

  interfaccia GNU R a servizi web RESTful

• dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

  pacchetto GNU R per l'analisi e la generazione di XML

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-genefilter

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-limma

  modelli lineari per dati di microarray

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  annotazioni a livello di tutto genoma per l'Uomo

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	4,970.1 kB	6,722.0 kB	[list of files]