Package: r-bioc-rsamtools (2.18.0+dfsg-1) [debports]
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- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R
Questo pacchetto fornisce un'interfaccia alle utilità "samtools", "bcftools" e "tabix" per la manipolazione di SAM (Sequence Alignment / Map), BCF (binary variant call) e file delimitati da tab indicizzati e compressi (tabix).
Other Packages Related to r-bioc-rsamtools
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libcurl4 (>= 7.18.0)
- libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.18
- Package not available
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)
- funzioni generiche per Bioconductor
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)
- rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor
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- dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)
- implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)
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- dep: r-bioc-zlibbioc
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- dep: r-cran-bitops
- pacchetto GNU R che implementa operazioni bit a bit
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-genomicalignments
- rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle
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- sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)
- classi e metodi GNU R per grosse moli di dati di sequenziamento short-read
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-runit
- pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità
Download r-bioc-rsamtools
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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hppa (unofficial port) | 3,506.9 kB | 5,731.0 kB | [list of files] |