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Package: fastlink (4.1P-fix100+dfsg-5 and others)

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versione più veloce dei programmi di Linkage per pedigree

L'analisi di linkage è una tecnica statistica usata per mappare geni e trovare la posizione approssimata di geni responsabili di malattie. Per le analisi di linkage esisteva un pacchetto software standard chiamato LINKAGE. FASTLINK è una versione fortemente modificata e migliorata del programma principale di LINKAGE che gira molto più velocemente in modo sequenziale, può essere eseguita in parallelo, permette all'utente di ripartire facilmente se il computer va in crash e fornisce abbondante documentazione nuova. FASTLINK è stato usato in più di 1000 studi genetici di linkage pubblicati.

Questo pacchetto contiene i seguenti programmi:

 ilink:    procedura di ottimizzazione GEMINI per trovare un valore locale
           ottimale per il vettore theta delle frazioni di ricombinazione;
 linkmap:  calcola i punteggi delle posizioni di un locus rispetto a una
           mappa fissata di altri loci;
 lodscore: compara la verosimiglianza corrispondente al theta locale
           ottimale;
 mlink:    calcola i punteggi LOD e il rischio con due o più loci;
 unknown:  identifica possibili genotipi per sconosciuti.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Need an extra tag, Works with: Need an extra tag

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 234.0 kB1,035.0 kB [list of files]
amd64 4.1P-fix100+dfsg-5 250.3 kB859.0 kB [list of files]
arm64 4.1P-fix100+dfsg-5+b1 240.4 kB1,036.0 kB [list of files]
armel 4.1P-fix100+dfsg-5 238.8 kB922.0 kB [list of files]
armhf 4.1P-fix100+dfsg-5 226.2 kB662.0 kB [list of files]
hppa (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 223.4 kB795.0 kB [list of files]
i386 4.1P-fix100+dfsg-5 248.1 kB902.0 kB [list of files]
ia64 (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 287.9 kB1,614.0 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 228.6 kB822.0 kB [list of files]
mips64el 4.1P-fix100+dfsg-5 237.9 kB1,067.0 kB [list of files]
ppc64 (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 253.3 kB1,227.0 kB [list of files]
ppc64el 4.1P-fix100+dfsg-5 253.7 kB1,099.0 kB [list of files]
riscv64 4.1P-fix100+dfsg-5 267.5 kB795.0 kB [list of files]
s390x 4.1P-fix100+dfsg-5 281.7 kB1,083.0 kB [list of files]
sh4 (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 265.1 kB1,034.0 kB [list of files]
sparc64 (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 229.6 kB5,264.0 kB [list of files]
x32 (unofficial port) 4.1P-fix100+dfsg-5 245.4 kB806.0 kB [list of files]