Paketti: fastlink (4.1P-fix100+dfsg-5 ja muut)

[ Source: fastlink  ]

faster version of pedigree programs of Linkage

Genetic linkage analysis is a statistical technique used to map genes and find the approximate location of disease genes. There was a standard software package for genetic linkage called LINKAGE. FASTLINK is a significantly modified and improved version of the main programs of LINKAGE that runs much faster sequentially, can run in parallel, allows the user to recover gracefully from a computer crash, and provides abundant new documentation. FASTLINK has been used in over 1000 published genetic linkage studies.

This package contains the following programs:

 ilink:    GEMINI optimization procedure to find a locally
           optimal value of the theta vector of recombination
           fractions
 linkmap:  calculates location scores of one locus against a
           fixed map of other loci
 lodscore: compares likelihoods at locally optimal theta
 mlink:    calculates lod scores and risk with two of more loci
 unknown:  identify possible genotypes for unknowns

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Need an extra tag, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin fastlink liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: fastlink-doc

  Some papers about fastlink

Imuroi fastlink

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	234.0 kt	1,035.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	4.1P-fix100+dfsg-5	250.3 kt	859.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	4.1P-fix100+dfsg-5+b1	240.4 kt	1,036.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	4.1P-fix100+dfsg-5	238.8 kt	922.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	4.1P-fix100+dfsg-5	226.2 kt	662.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	223.4 kt	795.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	4.1P-fix100+dfsg-5	248.1 kt	902.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	287.9 kt	1,614.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	228.6 kt	822.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	4.1P-fix100+dfsg-5	237.9 kt	1,067.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	253.3 kt	1,227.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	4.1P-fix100+dfsg-5	253.7 kt	1,099.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	4.1P-fix100+dfsg-5	267.5 kt	795.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	4.1P-fix100+dfsg-5	281.7 kt	1,083.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	265.1 kt	1,034.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	229.6 kt	5,264.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	4.1P-fix100+dfsg-5	245.4 kt	806.0 kt	[tiedostoluettelo]