Package: ltrsift (1.0.2-10)

[ Source: ltrsift  ]

post-elaborazione e classificazione di retrotrasposoni LTR

LTRsift è uno strumento grafico per desktop che fa post-elaborazione semi-automatica delle annotazioni di retrotrasposoni LTR predetti de novo, come quelle generate da LTRharvest e LTRdigest. La sua interfaccia facile da usare mostra i candidati per i retrotrasposoni LTR, le loro famiglie putative e la loro struttura in modo gerarchico, permettendo all'utente di "vagliare" ("sift") i risultati, a volte numerosi, del software di predizione de novo. Offre anche funzionalità di filtraggio e di classificazione personalizzabili.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Other Packages Related to ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  libreria Cairo per grafica 2D vettoriale

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  libreria GDK Pixbuf

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  libreria versatile di analisi del genoma

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

  libreria GLib di routine in C

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  libreria per interfacce utente grafiche GTK - vecchia versione

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  impaginazione e rendering di testo internazionalizzato

• rec: last-align

  confronto di sequenze biologiche su scala genomica

• rec: ncbi-blast+

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

Download ltrsift

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	87.6 kB	326.0 kB	[list of files]