Package: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9) [debports]

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assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte, versione lunga

Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.

Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.

Questo pacchetto installa versioni speciali in modalità lunga di Velvet, come raccomandato nei tutorial di Velvet.

Other Packages Related to velvet-long

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: velvet

  assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	245.2 kB	2,955.0 kB	[list of files]