Pakiet: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

Inne pakiety związane z velvet-long

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: velvet

  Nucleic acid sequence assembler for very short reads

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie velvet-long

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	245,2 KiB	2 955,0 KiB	[lista plików]