allinea sequenze RNA espresse su un modello DNA
Il progetto SIBsim4 si basa su sim4, che è un programma progettato per
allineare una sequenza DNA espressa con una sequenza genomica,
permettendo la presenza di introni. SIBsim4 è una riscrittura piuttosto
estesa del codice originale con in mente i seguenti obiettivi:
* miglioramento della velocità;
* possibilità di usare grandi, dell'ordine di cromosomi, sequenze di
DNA;
* output più dettagliato sui tipi di splicing;
* output più dettagliato sui siti polyA;
* varie correzioni e ripuliture del codice.